Музей природы Байкало-Ленского заповедника существует с 2001 года. Он создан на средства заповедника и гранта Глобального экологического фонда. Экспозиционнная площадь – 75м2. Музей адаптирован для ведения работы по экологическому просвещению школьников. В экспозиции музея – тематические диорамы, отражающие особенности природы заповедника и Западного Прибайкалья, витрины с экспонатами, картографический материал, в том числе электрифицированная карта заповедника на металлической основе с магнитными фигурками животных.

В музее проводятся занятия по биологии, экологии и байкаловедению, в том числе в игровой форме. Деятельность музея востребована – ежегодно его посещают 1 – 1,5 тыс. человек

В музее проводятся экскурсии по темам:

«Прогулка по заповеднику» - обзорная экскурсия о природе Байкало-Ленского заповедника.

«Жители Байкала» - рассказ о наиболее интересных животных, населяющих Байкал (14 видов рыб, в том числе омуль и голомянка, губки, гаммарусы, нерпа).

«Млекопитающие Прибайкалья» (медведь, лиса, волк, рысь, белка, косуля, изюбр, нерпа).

«Птицы побережий, гор и лесов» (27 видов птиц, в том числе серебристая чайка, сойка, глухарь, черный дятел, кедровка) – рассказ о птицах, населяющих Западное Прибайкалье.

Продолжительность экскурсий – 30-40 минут. По желанию посетителей проводятся закрепляющие игры и викторины. Посещение музея бесплатное.

В заповеднике имеется Визит-центр, в котором можно получить информацию об ООПТ Байкальского региона и посмотреть фильмы о природе (43 наименования). Кроме того, в Визитцентре проводятся образовательные семинары для педагогов, конференции, слеты, олимпиады для школьников и другие природоохранные акции.